La guerre froide s'aggrave et de nouvelles menaces politiques pèsent sur le Projet Blue Book. Dans leur dangereuse quête de vérité, le professeur J. Allen Hynek et le capitaine Michael Quinn doivent à tout prix approfondir leur théorie concernant la conspiration autour des ovnis. L’observation de nouveaux cas d'ovnis oblige le duo à remettre en question non seulement les multiples facettes d'une conspiration mondiale en pleine expansion, mais aussi la nature et l'origine même des ovnis dans un monde de plus en plus instable.